La creación de la Institución Educativa Pío XII, constituye un capítulo importante de la historia de Mocoa y el Putumayo, ligada a su desarrollo, por su aporte a la formación de juventudes, quienes hoy como profesionales y personas de bien se desempeñan en las diferentes áreas del saber y de producción de la región y del país.

En los inicios del siglo XX, encontramos las raíces de la fundación de la Escuela Primaria en el año 1907 y pasaron cincuenta años para la creación de la sección secundaria.

La sección secundaria fué fundada por Resolución Nro. 19 de fecha 19 de septiembre de 1.957, dictada por el Excelentísimo Sr. Obispo Fray Plácido Camilo Crous, Inspector General de la Educación en el Putumayo y ratificada por Decreto No 129 de fecha 19 de agosto de 1.958, dictado por el señor Comisario Especial Dr. José Félix Guerrero.

Comenzó a funcionar el primero de Octubre de 1.958 en el salón del convento de los R.R.P.P. misioneros capuchinos de la orden de San Francisco de Asís, con 26 alumnos de primer año, de los cuales terminaron 24.

Intervinieron para la consecución del Colegio, el Excelentísimo señor Obispo Fray Plácido Camilo Croux, el Reverendo Padre Fray Luis de Castellar, y los ciudadanos Dr. Jorge E. Viveros, Luis F. Quiroz, Anselmo Dávila, José J. Salazar, Felipe Hidalgo, Juan M, Herrera , Luis Max Bravo y Manuel J. Vivas.

Mocoa 1953 en el centro Padre Pascual de Castelar y Monseñor Camilo Croux.

El día 12 de Octubre de 1.958, se inauguró el colegio en las horas de la mañana en un acto solemne, tuvo lugar la bendición del salón donde iba a seguir funcionando el primer curso del “INSTITUTO PÍO XII SECCIÓN DE BACHILLERATO DE MOCOA”, en el convento de los reverendos Padres Misioneros Capuchinos, en cuyo acto de instalación llevaron la palabra los señores Enrique Morán, Luis F. Quiroz y el Reverendo padre Pascual de Castellar.